耿九畴（？—1460），字禹范，河南庐氏人，明朝永乐二十二年进士。历官给事中、两淮盐运同知，出镇陕西，转右副都御史、都御史、江西布政使，擢南京刑部尚书。以议论朝政得失，能务大体，颇有声望。
正统初年，耿九畴出任两淮盐运司同治。为革除旧弊，拟五条措施上奏皇帝，批准后以律令下达施行。后来，由于母丧离职，盐民数千人呈请皇帝留任。自耿九畴离任后，两淮的盐政又松弛了下来。
正统十年（1435），耿九畴起复后任都转运使。他为政清廉，生活节俭，无其他嗜好，公事之余惟焚香读书，廉洁之名，妇孺皆知。一次，耿九畴在水边感叹的说：「水这样清啊！」旁边一个小孩子说：「水清不如耿使君清。」后任刑部右侍郎。任内耿九畴不顾权贵阻挠，辩清了许多疑案。
景泰元年（1450），皇帝又命他兼理两淮盐政。接着奉命审查各府重要囚犯，多数冤案得以平反。景泰三年，耿九畴代陈镒镇抚陕西，发现都指挥杨得青等私自奴役兵卒，上奏弹劾并奉诏进行了处治。
一次，边将提出要增加临洮诸卫的戊兵，耿九畴说：「边城士卒并不少，只要将帅严肃纪律，赏罚严明，则人人可奋勇御敌。否则，再增戊兵，不过多耗费些钱粮而已。」从而说服了边将。
当时，边疆农民春夏在原籍耕作，一到秋冬，为躲避外族侵略，便举家迁移到塞内。耿九畴说：「边将的职责是抵御外族侵略和保卫边民的，今边民颠沛流离，要边将何用？」下令守军加强防卫，边民得以安居。
天顺初年，在朝中议事时，皇帝对周围的侍臣说：「九畴，廉正人也。」天顺四年（1460），耿九畴病逝，谥清惠。
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